En affrontant les énigmes de la matière, l'Adepte affrontait le plus souvent, et à l'époque sans guère le savoir, les énigmes les plus brûlantes de son esprit et de sa vie. Le thème du mariage philosophique, développé dans les traités alchimiques du XVIe siècle et des siècles suivants, s'apparente au processus psychologique qui implique la confrontation de l'inconscient et du conscient dont l'objet est de conduire l'homme vers son centre. Cette confrontation est traduite dans le symbolisme alchimique des époux philosophiques enfermés dans la chambre nuptiale. La Pierre Philosophale est l'enfant né de cette union, entendons : la découverte et la possession du Soi, l'individuation. C'est ainsi que l'homme apprendra à se recentrer, avec de plus en plus de fraternité, sur le seul bien dont il doit être tout à fait certain : sur lui-même, sur l'homme et ses étonnantes potentialités. Travaillant sur l'humaine substance, matière première effective du Grand Œuvre, les vrais disciples d'Hermès transmuent le plomb vil des bas instincts en pur or moral et intellectuel. Ces initiés ne se font aucune illusion sur la valeur des choses et ils possèdent tout parce qu'ils ne convoitent rien.