Mais Gilgamesh persiste dans sa décision et alors Shiduri le dirige vers Ur-Shanabi, le nocher d'Uta-Napishtim, qui se trouvait dans le voisinage. Ils traversent les Eaux de la mort et arrivent sur le rivage où vivait Uta-Napishtim. Gilgamesh lui demande comment il a acquis l'immortalité. Il apprend ainsi l'histoire du Déluge et pourquoi les dieux ont décidé de faire d'Uta-Napishtim et de son épouse leurs "parents" en les installant "aux embouchures des fleuves". Dans sa version mésopotamienne, le Déluge aboutit à l'instauration de règles pour limiter les effets négatifs causés par une surpopulation humaine qui renvoie aux questions de cohabitation et d'interdépendance entre dieux et humains.
