En 1775, la crainte d'une attaque diminue, les parties de la forteresse connues sous le nom de Rocher (la Roca) et l'Étoile (la Estrella) ont été converties en une prison pour détenus politiques, alors que le reste de la forteresse continuait à servir de base militaire.
La citadelle a de nouveau été utilisée comme forteresse en 1898, lorsque les États-Unis ont attaqué la flotte de Santiago-de-Cuba pendant la guerre hispano-américaine.