Les salles de prières sont situées derrière chaque eivân. Elles sont décorées très finement en mosaïques. Les couleurs dominantes sont le bleu et le turquoise, couleurs associées au ciel dans la tradition persane. Mais des couleurs comme le jaune, qui évoque le soleil et la lumière divine, et le vert sont assez caractéristiques de l'époque.
