Le 17 septembre 1991, l'administration diocésaine est informée que le Conseil municipal de Samarcande lui restitue la cathédrale Saint-Alexis. Elle est le seul édifice de culte du doyenné de Samarcande, datant de l'époque pré-Révolution d'Octobre, à être rendu aux chrétiens orthodoxes. La cathédrale est cependant dans un piteux état. La coupole et le porche en pierre de l'entrée principale ont disparu, de même que l'iconostase et le lustre principal, les icônes et les croix en fonte, et bien d'autres objets encore.
