Le bâtiment principal de la mosquée Kok Goumbaz est constitué d'une salle carrée d'environ 12 mètres de côté qui soutient la coupole par l'intermédiaire de trompes d'angles. Le tambour de la coupole porte l'inscription en carreaux émaillés blancs : "La souveraineté appartient à Allah, la richesse appartient à Allah." La coupole, qui a fait l'objet d'une récente restauration à cause de l'humidité, a retrouvé son ancienne splendeur. Le résultat est impressionnant de finesse.